Хвойные деревья могут серьезно пострадать от инфекционных заболеваний, хотя и не часто поражаются ими. Серьезным препятствием для роста и развития молодых деревьев и сеянцев в школках являются разные виды грибов, главным образом из рода Pythium и Rhizoctonia, которые вызывают медленное гниение, гибель корней и полегание сеянцев.
Помимо этого, сеянцы и молодые хвойные деревья часто страдают из-за фузариозного пересыхания (причина — анаморфный вид грибов Fusarium). Это болезнь по-другому называется трахеомикозным увяданием.
Почвенный патоген внедряется в корни растения, которые в результате буреют и медленно загнивают. Далее гриб проходит в сосудистую структуру, наполняя ее своей биомассой, что затрудняет проникновение витаминов.
В то же время, если сделать поперечный срез поврежденной ветви, то можно увидеть полное или прерывистое потемнение кольца одновременно и сердцевины, и ксилемы. Хвоя начинает желтеть, краснеть и опадать, крона истончается, растения начинают сохнуть.

Сначала болезнь протекает незаметно. Фузариоз пихты выделяет фузариоз из хвойного растения и ростков вредные вещества. Стимуляторы остаются в поврежденных частях хвойных растений и в большинстве случаев начинают распространяться через инфицированный посадочный материал питомников или через зараженную почву.
Техника безопасности при фузариозе можжевельника. Вылечить поврежденные растения не получится, так как они всё равно через несколько лет засохнут. Чтобы избежать корневой гнили и фузариоза, важно использовать свежий посадочный материал и вовремя удалить все засохшие образцы с корнями и поврежденными частями растений.
Для безопасности растительность с открытыми корнями нужно замочить в таких препаратах как, максим, витарос, фитоспорин-М, заранее подготовив раствор. При появлении побочных эффектов в почву вводят растворы таких биопрепаратов, как гамаир, агат-25К, фитоспорин-М и фунгицид фундазол. Положительный эффект получают, обработав семена перед посевом этими средствами и ТМТD.
